舊約《雅歌》四章16節的經文說：
北風啊，醒起來吧！南風啊，吹向我的花園，
使空氣洋溢著芬芳。
願我的愛人進入他的園中，吃園裏最好的果子。
十字架約翰引用了這一節的前半段經文，而以靈魂內在所需求的說出：「上主聖神的清風，乃是極高度可為人們願望的事件，每個靈魂，都應該要求這種清風，吹過他的花園，好使上主神聖的芳香，芬馨四溢。」
這是以色列的青年男女相互傾吐愛情的民間歌謠，聖經作者將這些動人的文辭放置在聖經的正典中，不只是描述中東地區的男女浪漫愛情，從靈性的意境上，這些經文確實可以引領人進入靈修的階梯，聖多瑪斯、聖伯納德、大德蘭、十字架約翰都從《雅歌》裡頭獲得靈修境界的泉源。
在聖愛之中上主之子將靈魂變成了祂自己，以天上恩賜豐腴的靈糧，給予人的靈魂，由於這極大的吸引力，靈魂與上主結合為一。
《雅歌》六章2～3節的經文又說：
我的愛人到自己的園子去，花床盛開著鳳仙花。
他在那裡牧放羊群，採摘百合花。
我的愛人是我的，我是他的；他在百合花叢中牧放羊群。
聖師以此比喻人與上主之間的「靈婚」，這是在秘密(神秘)中佔有、分享、了解的親密關係，彼此之間充滿愛情的動能，人的靈魂獲得最高尚方式的特恩（對此靈魂沒有言語述說的能力），靈魂被神聖之愛所陶醉、吸引與昇華；而上主將祂的神性，放置在人的理智，使人得以了解真理。
上
主將靈魂高舉到靈婚的境界上，是為轉化靈魂，靈魂在轉化為上主時，獲得上主的恩寵，十字架約翰說此為「清風的拂煦」，並且指出清風的拂煦是一種能力，由上
主聖靈所賞賜給靈魂的，將靈魂提拔到最崇高的境界；上主聖靈在靈魂內的呼吸，因此，上主才將靈魂轉化為祂自己，這一境界是人的語言無法描寫、人的理智無法
了解的。這時靈魂享受在靜靜的黑夜中，在其中實行著靜觀，靜觀是黑暗的，從神學的角度說，這是神祕神學。
《愛情》一開始是解說，十字架約翰從「靈魂在與上主的結合中，感到了全部的焚燒，感到了全部浸浴在光榮以及愛情之中，從祂實體的最親密處，噴射出了真正光榮與甜蜜的大河流」，大能的光、愛情之火燃燒包圍靈魂，而這火焰就是聖靈，使得靈魂向火焰投注熱切的願望。
聖師指出聖靈以靈魂所產生的作為，乃是熱火的噴射、愛情的焚燒，靈魂的意志用一種崇高的方式與聖靈結合。嚴格說，不是靈魂產生這樣的行為，而是聖靈在靈魂中產生這樣的行為。
靈魂至深的實體中，是感覺無法達到的，魔鬼也不會深入的，在此只有聖靈能在靈魂，這深處只有接受上主而已，聖師說：「靈魂的中心，乃是上主」。
我們發現十字架約翰的靈魂學說，與多瑪斯的靈魂論相當接近，靈魂是純粹的靈體。為了讓靈魂與上主完全結合，靈修人應放棄一切世俗之物，讓一切自然的傾向死去；靈魂的最後目的是「上主化」的功課，與聖靈結合達成一體的相通。
十字架約翰認為，三一神賜給深度的靈魂三種恩典：甘甜火熱的心、永生的滋味、轉化生命，這一切都是因為上主聖愛的烈焰，使得靈魂熊熊燃燒不能自己。
當代天主教士林哲學家 J. Maritain 在《知識的等級》(The Degrees of Knowledge)
一書裡頭，他談論十字架約翰時，稱呼聖師為「靜觀的實行者」。
「靜
觀」是十字架約翰靈修的主題之一，在他的四本著作中都提到了靜觀，根據關永中的研究他認為，十字架約翰在《登山》與《心靈》書中，將靜觀定義為理智上秘密
而更高的知識；在《黑夜》裡頭則靜觀被視為上主對於意志神秘的愛之傾注；在《愛情》中，靜觀是理智與意志所共同保有，對於上主秘密的愛之知識。
屬於神秘經驗的「靜觀」，有幾種可以從認識觀點來說明的特性：
超性的 supernatural（嚮往上主的生命）
靈性的 spiritual（屬於靜觀的神秘經驗知識，不來自感官（沒有形體的表象））
被動的 passive（從上主接受智慧與愛，且受靜觀的淨化）
無區別 indistinct（在靜觀中，人們忘懷時間、超越空間的限制）
普遍的 general（非個別的知識，只體會上主的臨在、聖神愛的熱火，對於上主聖愛無法有清晰可區別的辨認）
理智與意志密切合作（在愛中認知，在認知中熱愛）
根據十字架約翰對於靜觀的描寫，靜觀從靈修的角度，可以分成三個階段：
初步：人停止推理默想而進入靜觀（對於感性的圖像感到乏味、對於上主則有愛的感覺）
中期：理智與意志彼此相互影響（上主光照理智→愛之火 愛之火導引意志→對於上主更深的洞察）
高階：產生「愛的知識」（（靈魂與上帝之間的靈婚）透過靜觀更深入熱愛上主）
靜觀的三個階段，不斷出現在十字架約翰的靈修著作與主題中。靜觀幾乎是屬於「不可說」層次，聖師自己指出：
靜觀是上主對於靈魂的語言，為純粹精神對純粹精神的對話，是一切低於精神的感官所無法知覺的，對感官來說便是屬於秘密的，感官既無法認知,也無法論說,因為無法看到也就不能渴望。
靜觀是屬於上主的，具有秘密的屬性且超過人自然的能力，是導引靈魂至與上主完美結合的途徑，這一路途並非人所能了解，只能為那不可知、「上智的無知」所帶領。
法國士林哲學家 J. Maritain 在研究十字架約翰的專文中曾經說道：
人
類的一切方法，無論如何，在其與有關於他在自己的本生命需要佔有的上主一方面來
說，總是沒有比例，並且不適宜的。為此，一個受造物所能作的最高的事，乃是捨棄自己，消滅自己，拒絕並放棄自己的本有工作，而將自己成為空無，這是十字架
約翰的中心理論，如果不是有上主超自然的出現或親在於人靈之中（這是說一個已經為上主以最近方式召叫到靜觀的靈魂），這個空的理論，實在是悖謬絕倫的。是
的，如果不是上主來敲打靈魂的門，而要完全佔有他，補足他，要他為一個更好的生命而失去一切，這個最好的生命就是神自己，是和平的大河－－這種空無的理
論，乃是實在沒有意義的。
這是十字架約翰靈修的基本特徵：空無；空無到一切只為耶穌基督。這種空無的理論所講的也是一種死亡，一種生自我們內心的死亡，一種有生命動力的工作－－死亡（卻不是本體的死亡）。
對十字架約翰而言，「空無」與「黑暗」常常是通用的，在《登山》裡頭，他認為「在所 有事物上剝削自己的興味，就像生活在黑暗與空無」，而這種剝削對於靈魂來說是一種黑夜。51 在十字架約翰的著作中，「空無」(void)、「無」 (emptiness)、「黑暗」三名辭交替使用，信、望、愛三種神學美德，使得理智、意志、記憶三精神功能「空虛」在黑暗中，完成「理智在信仰的黑暗中，記憶進入希望的虛空裡頭，意志埋葬在一切情愛的缺乏中」而走向上主(對一切不是屬於上主的事物之棄絕)。
空無是一種靈修方法，從上主而來的能力；若從基督信仰的立場，基本上認為「空無」、「無」並非只是修煉而來的工夫，空無既是靜觀的境界，也是靜觀的方法，唯獨空無才能產生靜觀之「愛的知識」；靜觀的被動與無區分特性，更襯托出空無的能力來自上主。
